W sierpniu 1944 roku, w czasie Powstania Warszawskiego, był w stolicy na Ochocie. Po upadku dzielnicy, wyszedł z miasta z ludnością cywilną i przedostał się do Częstochowy.
Po wojnie, w 1947 roku, aresztowany za swoją działalność przez SB. Skazany na karę śmierci, zamordowany przez funkcjonariuszy Urzędu Bezpieczeństwa w warszawskim więzieniu na Mokotowie. Ostatniego komendanta NSZ, pochowano w mundurze Wehrmachtu. Znajdował się wśród 117 osób - ofiar represji komunistycznych - wydobytych w 2012 roku w czasie prowadzonych przez IPN ekshumacji na tzw. Łączce na warszawskich Powązkach. W latach 1948-1956 komuniści chowali tam członków podziemia zamordowanych przez UB. Jago szczątki zidentyfikowano w lutym 2013 roku.
Przypomnimy dziś słuchowisko "Umarli abyśmy mogli żyć. Stanisław Kasznica". Autorem audycji jest Sylwester Woroniecki, a realizatorem dźwięku - Aleksandra Mazur-Woroniecka.